Среда, 2020-10-28, 2:42 AM
Коллекция материаловГлавная

Регистрация

Вход
Приветствую Вас Гость | RSS
Меню сайта
Главная » 2014 » Сентябрь » 21 » Скачать Клиническое значение тестирования на вирус папилломы человека в скрининге цервикальной интраэпителиальной неоплазии. Комарова, бесплатно
1:40 AM
Скачать Клиническое значение тестирования на вирус папилломы человека в скрининге цервикальной интраэпителиальной неоплазии. Комарова, бесплатно
Клиническое значение тестирования на вирус папилломы человека в скрининге цервикальной интраэпителиальной неоплазии

Диссертация

Автор: Комарова, Евгения Владимировна

Название: Клиническое значение тестирования на вирус папилломы человека в скрининге цервикальной интраэпителиальной неоплазии

Справка: Комарова, Евгения Владимировна. Клиническое значение тестирования на вирус папилломы человека в скрининге цервикальной интраэпителиальной неоплазии : диссертация кандидата медицинских наук : 14.01.01 / Комарова Евгения Владимировна; [Место защиты: ГОУВПО "Московский государственный медико-стоматологический университет"] - Москва, 2010 - Количество страниц: 120 с. 17 ил. Москва, 2010 137 c. :

Объем: 137 стр.

Информация: Москва, 2010


Содержание:

Список сокращений Обзор литературы
I Роль вирусов папиллом человека в патогенезе шейки матки
1 Заболеваемость и факторы риска рака шейки матки (РШМ)
2 Ассоциация РШМ с инфекцией вирусами папиллом
3 Структура вирусного генома
4 Механизмы трансформирующего действия вирусных онкогенов
5 Персистенция вирусной ДНК
6 Интеграция вирусной ДНК в клеточный геном П Подходы к картированию и анотированию геномов высших эукариот
1 Генетическое картирование
2 Физическое картирование
21 Цитогенетическое картирование
22 Картирование на основе гибридов соматических клеток
23 Рестрикционное картирование генома человека
24 Контиг-карты хромосом человека на основе перекрывающихся клонов геномной ДНК человека
25 Картирование генома на основе радиационных гибридов соматических клеток (КН-картирование)
3 Предсказание генов человека с помощью компьютерных методов анализа последовательностей биополимеров
31 Молекулярно-биологические базы данных
31 Строение генов и подходы к их предсказанию в последовательностях генома человека Материалы и методы Результаты и их обсуждение
I Отработка метода радиационного картирования на примере локализации мозгоспецифичной последовательности ОАгЬ и маркера ОС-богатой последовательности ст§сЗО
1 Подбор праймеров и оптимизация условий полимеразной цепной реакции
2 Локализация исследуемых маркеров П Локализация последовательностей генома человека, прилегающих к местам встраивания вируса папилломы
1 Физическая локализация последовательностей, прилегающих к местам встраивания HPV16 методом RH-картирования на хромосомах человека
11 Оптимизация условий ПЦР, скрининг панели радиационных гибридов и определение локализации маркеров INT на RH-карте
12 Совмещение RH-карты с другими типами карт и поиск генов, прилегающих к местам встраивания HPV
2 Локализация in silico последовательностей, прилегающих к местам встраивания HPV16 в геноме человека
3 Поиск гомологии последовательностей, прилегающих к местам встраивания HPV16, с экспрессирующимися последовательностями человека
4 Анализ нуклеотидных последовательностей генома человека, прилегающих к местам встраивания HPV
41 Анализ нуклеотидных последовательностей генома человека, прилегающих к местам встраивания HPV16, с использованием сервиса Genomatrix Suite
42 Анализ геномных последовательностей человека, прилегающих с 3'-конца к интегрированной вирусной ДНК
5 Анализ гипотетических генов
51 Установление экзон-интронной структуры и поиск необходимых регуляторных элементов
52 Определение предположительной функции белков, кодируемых описанными генами
53 Анализ экспрессии изучаемых генов в различных органах и тканях

Введение:

Одной из важных задач современной генетики является изучение наследственных заболеваний человека и молекулярных механизмов онкогенеза.В этой связи активно ведутся исследования по поиску и изучению вирусных генов, связанных с развитием различных опухолей, а также последовательностей генома человека, в которые происходит встраивание вирусных генов.Вирус папилломы человека (HPV) относится к ДНК содержащим вирусам. Известно около 100 представителей HPV человека, из которых типы 16, 18 и им родственные ассоциированы с развитием рака шейки матки [De Villiers, 1994]. В связи с его высокой онкогенностью и распространенностью в популяции человека изучение HPV представляет немалый интерес, как для прикладной, так и для теоретической науки. HPV может существовать в клетке как в эписомальной, так и в интегрированной форме. Экспрессия вирусного генома происходит с использованием механизма сплайсинга, при этом экспрессируются два трансформирующих гена вируса Е6 и Е7, а в случае интегрированной формы и слитые с вирусными клеточные последовательности, расположенные с З'-конца встроенной ДНК вируса [Klaes et al., 1999; Киселев и др., 2001]. Часть интегрированных вирусных последовательностей остаются «молчащими» и не экспрессируются.В случае интеграции вирус теряет собственный сайт полиаденилирования. До последнего времени оставалось неизвестным, где происходит терминация транскрипции ДНК вируса при ее интеграции в геном человека.Как свидетельствуют литературные данные по локализации сайтов, в которые происходит встраивание вируса, интеграция HPV16 и других типов HPV может происходить в разные участки клеточного генома [el Awady et al., 1987; Cannizzaro et al., 1988; Sastre-Garau et al., 1990; Gilles et al., 1996; Wilke et al., 1996; Koopman et al., 1999; Thorland et al., 2000; Wentzensen, et a l , 2002].Многие авторы перечисленных работ указывают на близкое расположение к местам интеграции участков клеточного генома, часто подверженных хромосомным перестройкам и делециям, а также генов, прямо или косвенно участвующих в развитии онкозаболеваний. Локализацию в указанных работах проводили с использованием in situ гибридизации или панели гибридов соматических клеток, т.е. методов, не позволяющих определить точную физическую локализацию интегрированных последовательностей HPV.Несмотря на впечатляющие успехи в расшифровке первичной нуклеотидной последовательности, аннотирование генома человека далеко от завершения. Остаются не определенными функции и структура более 2/3 генов человека. Структура и предположительные функции большинства генов на настоящий момент определены in silico [Venter et al., 2001]. И хотя полученные компьютерными методами данные нельзя принимать как абсолютно достоверные, этап работы по аннотированию генома человека in silico является основой для дальнейших экспериментальных исследований и значительно облегчает планирование и постановку эксперимента.Физическое картирование на хромосомах человека мест интеграции ДНК вируса и их in silico анализ имеют большое значение для понимания того, как интегрированный вирусный геном может нарушать генетическую программу клетки.Целью данной работы были точная физическая локализация мест встраивания HPV16 в хромосомы человека и характеристика in silico геномных последовательностей, прилегающих к местам встраивания вирусной ДНК, транскрибируемой в клетках плоскоклеточного рака шейки матки.Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи: 1) отработка метода картирования с использованием панели радиационных гибридов соматических клеток (RH-картирование); 2) определение физической локализации геномных последовательностей, прилегающих к местам встраивания транскрибируемой ДНК вируса папилломы тип 16 (маркеры INT) в хромосомы человека в клетках плоскоклеточного рака шейки матки методом RH-картирования и картирования in silico; 3) анализ in silico последовательностей генома человека, прилегающих к местам встраивания HPV16, и структурно-функциональный анализ гипотетических генов, в последовательности которых происходит интеграция ДНКНРУ16; 4) поиск т зШсо в геномных последовательностях человека возможных сайтов терминации транскрипции интегрированной ДНК вируса; 5) экспериментальное подтверждение методом ОТ-ПЦР транскрипционной активности проанализированных гипотетических генов человека.

Скачивание файла!Для скачивания файла вам нужно ввести
E-Mail: 1662
Пароль: 1662
Скачать файл.
Просмотров: 150 | Добавил: Диана33 | Рейтинг: 0.0/0
Форма входа
Поиск
Календарь
«  Сентябрь 2014  »
ПнВтСрЧтПтСбВс
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
2930
Архив записей
Друзья сайта
  • Официальный блог
  • Сообщество uCoz
  • FAQ по системе
  • Инструкции для uCoz
  • Copyright MyCorp © 2020 Создать бесплатный сайт с uCoz